Ciències Òmiques
La unitat de Ciències Òmiques és una unitat mixta formada per investigadors de la Universitat Rovira i Virgili i Eurecat. Desenvolupa la seva activitat utilitzant les infraestructures punteres del Centre de Ciències Òmiques (COS), que constitueix un centre singular amb la tecnologia més puntera en metabolòmica, proteòmica, transcriptòmica i genòmica. Ofereix una gamma completa de serveis de recerca de biomarcadors en els diferents àmbits de la salut, alimentació i medi ambient, des de el suport en el disseny de projectes fins a l’anàlisi i integració de les dades obtingudes en diferents tecnologies òmiques.
Experiència
Biomarcadors
Àmplia experiència en la combinació de dades òmiques (genòmica, transcriptómica, proteòmica i metabolòmica) tant en biofluïds com diferents teixits per oferir una visió global completa dels canvis metabòlics que ocorren en un sistema biològic.
Les dades òmiques generades es poden usar per descobrir nous biomarcadores i per comprendre millor una patologia, i estudiar-ne els mecanismes d’acció i els efectes esperats i inesperats de diferents teràpies, així com per generar noves hipòtesis.
Els biomarcadors moleculars (gens, proteïnes, metabòlits, …) es poden utilitzar per a la predicció de malalties, l’estratificació de malalts i pel monitoratge de tractaments.
Metagenòmica
Estudis de canvis de la composició i distribució dels microbiomes en la salut humana i animal, i en mostres de sòls i altres del medi ambient.
Les anàlisis de metagenòmica poden incloure enfocaments de seqüenciació tradicionals del gen 16sRNA mitjançant tecnologia Sanger per a bacteris i aquells que es poden cultivar al laboratori, així com anàlisi avançada de la comunitat microbiana de diferents regions del gen 16sRNA a través de seqüenciació massiva amb la Plataforma Ion Torrent.
Sòlida experiència en l’anàlisi de la biodiversitat bacteriana i les conversions metabòliques dels compostos dietètics ingerits per acció dels microorganismes de la microbiota intestinal.
Oferim estudis avançats de metaproteòmica per ampliar la comprensió de les capacitats funcionals de cada espècie dins de la comunitat.
Seguretat alimentària
Desenvolupament de les aplicacions de tecnologies òmiques a diferents tipus de frau alimentari.
Les tecnologies òmiques ofereixen una opció inestimable per detectar l’autenticitat i la integritat dels aliments. A partir de l’anàlisi de seqüències d’ADN específiques o del perfil d’empremtes dactilars d’àcids grassos, hi ha nombroses possibilitats perquè aquests enfocaments es converteixin en una eina real per a l’avaluació de la seguretat alimentària.
Les aplicacions de plataformes analítiques comuns en altres enfocaments òmics també s’han demostrat valuoses a l’hora de proporcionar informació crítica sobre la composició bioquímica de diversos productes alimentaris.
Bioinformàtica i Bioestadística
Els anàlisis de metodologies òmiques individuals, com la seqüenciació de ADN i ARN, seqüenciació de proteïnes, expressió gènica, assemblatges de genoma, anàlisis de PTM, la interacció proteïna-proteïna i identificació i quantificació de metabòlits, entre altres…
També cal remarcar els estudis d’integració de dades multiòmiques, els anàlisis estadístiques, construcció de models predictius mitjançant Machine Learning, Virtual Screening de molècules petites i Target Fishing (Reverse Virtual Screening) per trobar noves possibles dianes per compostos coneguts.
Serveis
Metabolòmica dirigida i no dirigida
Disseny de projectes de metabolòmica.
Metabolòmica no dirigida mitjançant LC-MS.
Metabolòmica no dirigida mitjançant GC-MS.
Perfils metabolòmics mitjançant Ressonància Magnètica Nuclear.
Lipidòmica.
Estudis del metabolisme energètic.
Anàlisis de grups de metabòlits: aminoàcids, àcids grassos de cadena curta, acylcarnitines, …
Proteòmica
Disseny de projectes de proteòmica.
Projectes de proteòmica comparativa/ quantitativa label free.
Projectes de proteòmica comparativa/ quantitativa amb marcatge isobàric.
Estudis de fosfoproteòmica.
Estudis de glicosilacions.
Anàlisis de proteòmica dirigida per LC-MS/MS (MRM).
Anàlisis de proteòmica dirigida per ELISA i/o Milliplex.
Proteòmica de complexes (MSIA).
Projectes de proteòmica de proteïna intacta.
Metaproteòmica de poblacions bacterianes complexes.
Genòmica i Transcriptòmica
Disseny de projectes de Genòmica i Transcriptòmica.
Projectes de seqüenciació massiva: Resequencing, seqüenciació de novo, …
Estudis de mapeig de regions promotores. Chipseq.
Estudis de genotipatge.
Estudis d’exomes.
Projectes d’expressió gènica mitjançant plataforma de Microaarrays.
Projectes d’expressió gènica mitjançant plataforma de RNAseq.
Metagenòmica per 16sRNA de poblacions bacterianes complexes.
Bioinformàtica i Bioestadística
Bioestadística (comparació entre grups, correlacions de variables, etc.) per qualsevol tipus de dades (òmiques o no).
Anàlisis de vies metabòliques.
Anàlisis de microarray i RNA-Seq.
Ensamblatge, mapeig i anotació de genomes procariotes i eucariotes petits.
Anàlisis metagenòmiques (processament de dades, identificació taxonòmica, anàlisis estadístiques).
Construcció de models predictius mitjançant Machine Learning. Correlació d’impacte de gens i proteïnes amb malalties.
Desenvolupament i automatització de workflows per processament i anàlisi de dades.
Virtual Screening de molecules petites, per trobar possibles nous compostos amb una activitat concreta.
Target Fishing (Reverse Virtual Screening) per trobar noves possibles dianes per compostos coneguts.
Formació
Els nostres experts tenen àmplia experiència en metabolòmica, bioinformàtica, estadística i diversos camps d’aplicació, que van des de l’alimentació a la indústria farmacèutica.
Ajudem a les empreses a:
- Planificar, realitzar o informar sobre el seu estudi amb mètodes òmics.
- El disseny experimental, la selecció de tecnologia o la integració de dades.
- Interpretar els resultats provinents de diferents tecnologies òmiques (Genòmica, Transcriptòmica, Proteòmica o Metabolòmica).
Sectors més representatius
Projectes més rellevants
Pafort
PAFORT pretén reemplaçar les carències nutricionals que presenten determinats grups de la població a partir del consum de productes fermentats amb un perfil nutricional saludabel, organolèpticament atractius i sense encariment del preu en el producte final.
Go Lacteos
Disseny de metodologies i tècniques analítiques adequades per identificar i quantificar els diferents tipus de llets (vaca, ovella i cabra) utilitzats en la fabricació dels formatges de mescla.
Preventomics
Sistema basat en biomarcadors d’enviament de consells personalitzats sobre hàbits saludables i nutrició orientats a millorar la salut i prevenir l’aparició de malalties.
Equip Ciències Òmiques
Núria Canela
Directora de la Unitat de Ciències Òmiques d’Eurecat
Doctora en Farmàcia per la Universitat de Barcelona (2002). Compta una llarga experiència tant en el marc de la investigació acadèmica com industrial i ha format part de Plataformes i Serveis Científics i Tècnics dedicats a les Ciències Òmiques (Genòmica, Transcriptòmica, Proteòmica i Metabolòmica). És coautora de diversos articles d’investigació en revistes internacionals, i els seus principals contribucions científiques se centren en el camp de la proteòmica funcional i en la millora i la integració de tota la informació obtinguda amb diverses metodologies òmiques, per poder generar una visió holística més realista de la biologia de sistemes. Tots aquests treballs li han permès acumular experiència en una àmplia gamma de biotecnologies. Actualment el seu treball en la Unitat Tecnològica de Ciències Òmiques de Eurecat, es centra en l’aplicació de les metodologies Òmiques a l’estudi de sistemes biològics, des dels més senzills com els cultius cel·lulars, fluids biològics, teixits, fins als més complexes com són les comunitats microbianes de la microbiota humana.
Actualitat
Eurecat lidera un estudi sobre els beneficis de la dieta mediterrània per reduir l’obesitat juvenil
El centre tecnològic Eurecat lidera el projecte MED4Youth, que desenvoluparà un estudi clínic a nivell europeu amb l'objectiu de demostrar que una dieta mediterrània hipocalòrica i enriquida amb productes característics del Mediterrani, com la magrana, els cigrons, els fruits secs i el pa de massa mare de cultiu, és més [...]
El COS participa en un estudi massiu de característiques sanguínies de persones amb Covid-19 per trobar biomarcadors de pronòstic de la malaltia
El Departament de Salut finançarà amb 4 milions d'euros un total de 19 projectes de recerca i innovació per a la prevenció i tractament de la malaltia Covid-19, entre els quals hi ha el projecte "Biomarcadors pronòstics circulatoris i cel·lulars per a la progressió de Covid19 en pacients amb infecció [...]
Eurecat participa en el programa Orfeu per al cribratge massiu de la població en la detecció de la Covid-19
L’Àrea de Biotecnologia del centre tecnològic Eurecat participa en el Programa Orfeu de la Generalitat de Catalunya per a la detecció massiva de la Covid-19, mitjançant la tècnica de PCR, amb l’objectiu de complementar la capacitat del sistema de salut de disposar de tests diagnòstic del coronavirus, mitjançant el Centre [...]