{"id":116092,"date":"2021-07-16T11:00:21","date_gmt":"2021-07-16T10:00:21","guid":{"rendered":"https:\/\/eurecat.org\/?p=116092"},"modified":"2021-07-16T11:06:12","modified_gmt":"2021-07-16T10:06:12","slug":"plataforma-digital-procesar-datos-omicos-gran-escala","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/eurecat.org\/es\/plataforma-digital-procesar-datos-omicos-gran-escala\/","title":{"rendered":"Desarrollar\u00e1n una plataforma digital para procesar datos \u00f3micos a gran escala con Big Data e Inteligencia Artificial"},"content":{"rendered":"<p>El centro tecnol\u00f3gico <strong><a href=\"http:\/\/eurecat.org\/es\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Eurecat<\/a><\/strong> coordina el proyecto europeo <strong><a href=\"https:\/\/glomicave.eu\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Glomicave<\/a><\/strong>, que desarrollar\u00e1 una nueva plataforma digital capaz de procesar <strong>datos \u00f3micos<\/strong> a gran escala mediante <strong>Big Data<\/strong> e <strong>Inteligencia Artificial<\/strong>, maximizando el uso de datos preexistentes, con el fin de aumentar la comprensi\u00f3n de los sistemas biol\u00f3gicos en su conjunto.<\/p>\n<p>En concreto, el proyecto, que cuenta con una financiaci\u00f3n de 6.372.583 euros, aborda la necesidad de construir sistemas que permitan relacionar genotipos, es decir, el conjunto de contenido gen\u00e9tico de un organismo, con fenotipos, que constituyen las caracter\u00edsticas visibles del organismo resultado de la interacci\u00f3n entre su genotipo y el medio ambiente, a trav\u00e9s de la integraci\u00f3n de datos \u00f3micos experimentales con datos disponibles en repositorios p\u00fablicos y en textos cient\u00edficos.<\/p>\n<p>El proyecto \u201cpondr\u00e1 al alcance de expertos de los \u00e1mbitos cient\u00edfico e industrial y de profesionales no expertos una herramienta que les ayudar\u00e1 a identificar y comprender nuevos v\u00ednculos entre genotipos y fenotipos animales, vegetales y ambientales\u201d, explica la coordinadora del proyecto Glomicave, Biotza Gutierrez, gestora de programas p\u00fablicos del centro tecnol\u00f3gico Eurecat.<\/p>\n<p>De acuerdo con N\u00faria Canela, directora de la Unidad de Ciencias \u00d3micas, una unidad de I+D+i mixta formada por profesionales de Eurecat y de la Universitat Rovira i Virgili (URV), \u201cla integraci\u00f3n multi-\u00f3mica enriquecida con la extracci\u00f3n e interpretaci\u00f3n automatizada del conocimiento contenido en textos cient\u00edficos permitir\u00e1 aumentar la comprensi\u00f3n de los sistemas biol\u00f3gicos y realizar asociaciones genotipo-fenotipo m\u00e1s precisas, a la vez que permitir\u00e1 racionalizar el dise\u00f1o experimental de nuevos estudios\u201d.<\/p>\n<p>En Glomicave, \u201cla literatura cient\u00edfica, hecha por humanos y para humanos, se transformar\u00e1 en una base de conocimiento computacional, es decir, en un gr\u00e1fico de conocimiento. Esto permitir\u00e1 a los usuarios consultar operaciones para encontrar nuevos enlaces genotipo-fenotipo ocultos no descritos expl\u00edcitamente en la literatura, y tambi\u00e9n integrar esta informaci\u00f3n con nuevos datos experimentales en estudios cient\u00edficos\u201d, a\u00f1ade N\u00faria Canela.<\/p>\n<p>Con este objetivo, se utilizar\u00e1n estrategias de miner\u00eda de datos para recopilar y extraer informaci\u00f3n de la literatura cient\u00edfica, junto con el procesamiento del lenguaje natural (NLP) para interpretar la informaci\u00f3n e integrarla en la base de conocimiento. Se adaptar\u00e1n y ampliar\u00e1n m\u00e9todos de extracci\u00f3n de informaci\u00f3n de \u00faltima generaci\u00f3n para texto biom\u00e9dico para crear y llenar gr\u00e1ficos de conocimiento existentes que representen entidades y conceptos biol\u00f3gicos. Se pondr\u00e1 el foco en los m\u00e9todos que proporcionen extracciones interpretables y verificables.<\/p>\n<p>La plataforma impulsada por el proyecto Glomicave se validar\u00e1 en tres sectores industriales diferentes como la ganader\u00eda, la agrobiotecnolog\u00eda y el medio ambiente, y se abordar\u00e1n retos espec\u00edficos en seis casos de negocio como la tecnolog\u00eda de reproducci\u00f3n animal, la calidad de la carne, el crecimiento y calidad de la fruta, el crecimiento de las plantas, la eliminaci\u00f3n y recuperaci\u00f3n de f\u00f3sforo y la producci\u00f3n de bioenerg\u00eda en el ciclo del agua urbana.<\/p>\n<p>El proyecto Glomicave cuenta con la financiaci\u00f3n del programa Horizon 2020 de la Uni\u00f3n Europea y con un consorcio formado por 15 socios de Espa\u00f1a, Francia, Alemania, Portugal, B\u00e9lgica y Dinamarca. Participan cuatro centros tecnol\u00f3gicos y de investigaci\u00f3n como Eurecat, coordinador del proyecto, SERIDA, INRAE y Forschungszentrum Julich; tres universidades como Aalborg University, University of Minho y Katholieke Universiteit Leuven; cuatro peque\u00f1as y medianas empresas como ASINCAR, TREE Technology, Allice y AkiNaO; dos grandes empresas como NEC Laboratories Europe y Aguas do Norte; el cl\u00faster animal ASEAVA, y UNE como organismo de estandarizaci\u00f3n.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>El centro tecnol\u00f3gico Eurecat coordina el proyecto europeo Glomicave, que desarrollar\u00e1 una nueva plataforma digital capaz de procesar datos \u00f3micos a gran escala mediante Big Data e Inteligencia Artificial, maximizando el uso de datos preexistentes, con el fin de aumentar la comprensi\u00f3n de los sistemas biol\u00f3gicos en su conjunto. 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