PROMESI

Plataforma crowdsourcing en la nube para la anotación masiva de metabolitos en experimentos biomédicos.

El proyecto PROMESI diseña las bases para permitir una anotación masiva de metabolitos.

En primer lugar, PROMESI proporciona una identificación integral de los metabolitos presentes en muestras biológicamente relevantes, lo que permite a otros investigadores utilizar esta información para acelerar el proceso de anotación en sus experimentos.

Por otra parte, PROMESI diseña un método para permitir la traducción de información sobre el tiempo de retención (RT) a través de distintos métodos cromatográficos, facilitando el intercambio de información RT de datos generados en otros laboratorios.

Por último, la iniciativa integra estos recursos en una plataforma de anotación basada en la nube, utilizando crowdsourcing para aprovechar la contribución de la comunidad para crear una base de datos de metabolitos que contenga información espectral y RT.

Esta plataforma crowdsourcing también tiene la capacidad de descubrir espectros de metabolitos desconocidos pero recurrentes, es decir, espectros sin identificar observados en distintas muestras y que no se encuentran en librerías espectrales. En este sentido, al combinar RT e información espectral en una aplicación web, se puede obtener fácilmente una lista de metabolitos anotados presentes en las muestras, lo que permite un análisis a gran escala de datos que ha sido esencial en el avance de la proteómica y genómica.

Eurecat participa en el proyecto PROMESI a través del Centro de Ciencias Ómicas.