PROMESI

Plataforma crowdsourcing en el núvol per a l’anotació massiva de metabòlits en experiments biomèdics.

El projecte PROMESI dissenya les bases per a permetre una anotació massiva de metabòlits.

En primer lloc, PROMESI proporciona una identificació integral dels metabòlits presents en mostres biològicament rellevants, la qual cosa permet a altres investigadors puguin usar aquesta informació per a accelerar el procés d’anotació en els seus experiments.

Per altra banda, PROMESI dissenya un mètode per a permetre la traducció d’informació sobre el temps de retenció (RT) a través de diferents mètodes cromatogràfics, facilitant l’intercanvi d’informació RT de dades generades en altres laboratoris.

Finalment, la iniciativa integra aquests recursos en una plataforma d’anotació basada en el núvol, utilitzant crowdsourcing per a aprofitar la contribució de la comunitat per a crear una base de dades de metabòlits que contingui informació espectral i RT.

Aquesta plataforma crowdsourcing també té la capacitat de descobrir espectres de metabòlits desconeguts però recurrents, és a dir, espectres sense identificar observats en diferents mostres i que no es troben en llibreries espectrals. En aquest sentit, en combinar RT i informació espectral en una aplicació web, es pot obtenir fàcilment una llista de metabòlits anotats presents en les mostres, la qual cosa permet una anàlisi a gran escala de dades que ha estat essencial en l’avanç de la proteòmica i genòmica.

Eurecat participa en el projecte PROMESI a través del Centre de Ciències Òmiques.